Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCHS1Q96JQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DCHS1Q96JQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCHS1Q96JQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCHS1Q96JQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCHS1Q96JQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DCHS1Q96JQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DCHS1Q96JQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DCHS1Q96JQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DCHS1Q96JQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCHS1Q96JQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCHS1Q96JQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCHS1Q96JQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCHS1Q96JQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCHS1Q96JQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCHS1Q96JQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCHS1Q96JQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCHS1Q96JQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCHS1Q96JQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DCHS1Q96JQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCHS1Q96JQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCHS1Q96JQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCHS1Q96JQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCHS1Q96JQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DCHS1Q96JQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DCHS1Q96JQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCHS1Q96JQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DCHS1Q96JQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCHS1Q96JQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms