Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN17Q96FV3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN17Q96FV3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN17Q96FV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN17Q96FV3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN17Q96FV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN17Q96FV3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN17Q96FV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN17Q96FV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN17Q96FV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN17Q96FV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSPAN17Q96FV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms