Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHISA4Q96DD7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHISA4Q96DD7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHISA4Q96DD7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SHISA4Q96DD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SHISA4Q96DD7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SHISA4Q96DD7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHISA4Q96DD7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHISA4Q96DD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHISA4Q96DD7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHISA4Q96DD7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHISA4Q96DD7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHISA4Q96DD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SHISA4Q96DD7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHISA4Q96DD7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHISA4Q96DD7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHISA4Q96DD7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHISA4Q96DD7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHISA4Q96DD7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHISA4Q96DD7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHISA4Q96DD7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms