Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TLCD1Q96CP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TLCD1Q96CP7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLCD1Q96CP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLCD1Q96CP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLCD1Q96CP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TLCD1Q96CP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLCD1Q96CP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLCD1Q96CP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TLCD1Q96CP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TLCD1Q96CP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TLCD1Q96CP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TLCD1Q96CP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TLCD1Q96CP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLCD1Q96CP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLCD1Q96CP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TLCD1Q96CP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TLCD1Q96CP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TLCD1Q96CP7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TLCD1Q96CP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TLCD1Q96CP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TLCD1Q96CP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TLCD1Q96CP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TLCD1Q96CP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TLCD1Q96CP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TLCD1Q96CP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TLCD1Q96CP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TLCD1Q96CP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms