Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF21AQ96BD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF21AQ96BD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF21AQ96BD5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF21AQ96BD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF21AQ96BD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF21AQ96BD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF21AQ96BD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF21AQ96BD5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF21AQ96BD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms