Protein–RNA interactions for Protein: Q969L4

LSM10, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM10Q969L4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM10Q969L4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM10Q969L4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM10Q969L4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM10Q969L4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM10Q969L4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSM10Q969L4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM10Q969L4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM10Q969L4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM10Q969L4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LSM10Q969L4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM10Q969L4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms