Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAMP4Q969E2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAMP4Q969E2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAMP4Q969E2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAMP4Q969E2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAMP4Q969E2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAMP4Q969E2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCAMP4Q969E2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAMP4Q969E2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAMP4Q969E2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAMP4Q969E2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP4Q969E2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP4Q969E2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAMP4Q969E2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAMP4Q969E2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms