Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAPC3Q92966 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAPC3Q92966 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC3Q92966 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAPC3Q92966 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAPC3Q92966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC3Q92966 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAPC3Q92966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms