Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCG3Q8WXD2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCG3Q8WXD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCG3Q8WXD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCG3Q8WXD2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCG3Q8WXD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCG3Q8WXD2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCG3Q8WXD2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCG3Q8WXD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCG3Q8WXD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCG3Q8WXD2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms