Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWP7

GIMAP1, GTPase IMAP family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP1Q8WWP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMAP1Q8WWP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMAP1Q8WWP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMAP1Q8WWP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMAP1Q8WWP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMAP1Q8WWP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GIMAP1Q8WWP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIMAP1Q8WWP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIMAP1Q8WWP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIMAP1Q8WWP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIMAP1Q8WWP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GIMAP1Q8WWP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIMAP1Q8WWP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIMAP1Q8WWP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms