Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC13Q8WW36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC13Q8WW36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC13Q8WW36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC13Q8WW36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC13Q8WW36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC13Q8WW36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC13Q8WW36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZCCHC13Q8WW36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC13Q8WW36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZCCHC13Q8WW36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms