Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTSF1Q8WW33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTSF1Q8WW33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTSF1Q8WW33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSF1Q8WW33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTSF1Q8WW33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTSF1Q8WW33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTSF1Q8WW33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTSF1Q8WW33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms