Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC4Q8WW27 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC4Q8WW27 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC4Q8WW27 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC4Q8WW27 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC4Q8WW27 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC4Q8WW27 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC4Q8WW27 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC4Q8WW27 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC4Q8WW27 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms