Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BLNKQ8WV28 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BLNKQ8WV28 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BLNKQ8WV28 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BLNKQ8WV28 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BLNKQ8WV28 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BLNKQ8WV28 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BLNKQ8WV28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BLNKQ8WV28 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BLNKQ8WV28 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLNKQ8WV28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BLNKQ8WV28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms