Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9orf43Q8TAL5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9orf43Q8TAL5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9orf43Q8TAL5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9orf43Q8TAL5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9orf43Q8TAL5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C9orf43Q8TAL5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C9orf43Q8TAL5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9orf43Q8TAL5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9orf43Q8TAL5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf43Q8TAL5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C9orf43Q8TAL5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C9orf43Q8TAL5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms