Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGMS2Q8NHU3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGMS2Q8NHU3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGMS2Q8NHU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGMS2Q8NHU3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGMS2Q8NHU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGMS2Q8NHU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGMS2Q8NHU3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS2Q8NHU3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms