Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG16L2Q8NAA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG16L2Q8NAA4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG16L2Q8NAA4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG16L2Q8NAA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG16L2Q8NAA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG16L2Q8NAA4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L2Q8NAA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG16L2Q8NAA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms