Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
TCP11L2Q8N4U5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TCP11L2Q8N4U5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TCP11L2Q8N4U5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TCP11L2Q8N4U5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TCP11L2Q8N4U5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TCP11L2Q8N4U5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TCP11L2Q8N4U5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TCP11L2Q8N4U5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TCP11L2Q8N4U5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TCP11L2Q8N4U5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TCP11L2Q8N4U5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
TCP11L2Q8N4U5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TCP11L2Q8N4U5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TCP11L2Q8N4U5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TCP11L2Q8N4U5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TCP11L2Q8N4U5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TCP11L2Q8N4U5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCP11L2Q8N4U5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCP11L2Q8N4U5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TCP11L2Q8N4U5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TCP11L2Q8N4U5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
TCP11L2Q8N4U5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TCP11L2Q8N4U5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TCP11L2Q8N4U5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TCP11L2Q8N4U5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TCP11L2Q8N4U5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TCP11L2Q8N4U5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TCP11L2Q8N4U5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TCP11L2Q8N4U5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
TCP11L2Q8N4U5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TCP11L2Q8N4U5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TCP11L2Q8N4U5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TCP11L2Q8N4U5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TCP11L2Q8N4U5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TCP11L2Q8N4U5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms