Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHCHD4Q8N4Q1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHCHD4Q8N4Q1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHCHD4Q8N4Q1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHCHD4Q8N4Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHCHD4Q8N4Q1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHCHD4Q8N4Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHCHD4Q8N4Q1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHCHD4Q8N4Q1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHCHD4Q8N4Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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