Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT222Q8N1A0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT222Q8N1A0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT222Q8N1A0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT222Q8N1A0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT222Q8N1A0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT222Q8N1A0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT222Q8N1A0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT222Q8N1A0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT222Q8N1A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KRT222Q8N1A0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT222Q8N1A0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT222Q8N1A0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT222Q8N1A0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT222Q8N1A0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT222Q8N1A0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT222Q8N1A0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT222Q8N1A0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT222Q8N1A0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT222Q8N1A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT222Q8N1A0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT222Q8N1A0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT222Q8N1A0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT222Q8N1A0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT222Q8N1A0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT222Q8N1A0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms