Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA2D3Q8IZS8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D3Q8IZS8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D3Q8IZS8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D3Q8IZS8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA2D3Q8IZS8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D3Q8IZS8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNA2D3Q8IZS8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNA2D3Q8IZS8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA2D3Q8IZS8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms