Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM1Q8IZ96 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM1Q8IZ96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM1Q8IZ96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM1Q8IZ96 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM1Q8IZ96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM1Q8IZ96 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM1Q8IZ96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM1Q8IZ96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM1Q8IZ96 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM1Q8IZ96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM1Q8IZ96 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM1Q8IZ96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM1Q8IZ96 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms