Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC103Q8IW40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC103Q8IW40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC103Q8IW40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC103Q8IW40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC103Q8IW40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC103Q8IW40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC103Q8IW40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC103Q8IW40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms