Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RASSF3Q86WH2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASSF3Q86WH2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms