Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASSF3Q86WH2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASSF3Q86WH2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASSF3Q86WH2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RASSF3Q86WH2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RASSF3Q86WH2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASSF3Q86WH2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASSF3Q86WH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASSF3Q86WH2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASSF3Q86WH2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASSF3Q86WH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASSF3Q86WH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASSF3Q86WH2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms