Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE3

ZNF546, Zinc finger protein 546, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546Q86UE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF546Q86UE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF546Q86UE3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF546Q86UE3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF546Q86UE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF546Q86UE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF546Q86UE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF546Q86UE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF546Q86UE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF546Q86UE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF546Q86UE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms