Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRC3Q7RTR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRC3Q7RTR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRC3Q7RTR2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC3Q7RTR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRC3Q7RTR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRC3Q7RTR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRC3Q7RTR2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NLRC3Q7RTR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRC3Q7RTR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC3Q7RTR2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC3Q7RTR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRC3Q7RTR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms