Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
OTOP1Q7RTM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
OTOP1Q7RTM1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
OTOP1Q7RTM1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
OTOP1Q7RTM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
OTOP1Q7RTM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
OTOP1Q7RTM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
OTOP1Q7RTM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
OTOP1Q7RTM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
OTOP1Q7RTM1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
OTOP1Q7RTM1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
OTOP1Q7RTM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
OTOP1Q7RTM1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
OTOP1Q7RTM1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
OTOP1Q7RTM1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
OTOP1Q7RTM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
OTOP1Q7RTM1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
OTOP1Q7RTM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
OTOP1Q7RTM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
OTOP1Q7RTM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
OTOP1Q7RTM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
OTOP1Q7RTM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
OTOP1Q7RTM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
OTOP1Q7RTM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
OTOP1Q7RTM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
OTOP1Q7RTM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
OTOP1Q7RTM1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
OTOP1Q7RTM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms