Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPUQ71F23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPUQ71F23 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPUQ71F23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPUQ71F23 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPUQ71F23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPUQ71F23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPUQ71F23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPUQ71F23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPUQ71F23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPUQ71F23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPUQ71F23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPUQ71F23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPUQ71F23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPUQ71F23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPUQ71F23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPUQ71F23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPUQ71F23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPUQ71F23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPUQ71F23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPUQ71F23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms