Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHSY3Q70JA7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHSY3Q70JA7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHSY3Q70JA7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHSY3Q70JA7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHSY3Q70JA7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHSY3Q70JA7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHSY3Q70JA7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHSY3Q70JA7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHSY3Q70JA7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHSY3Q70JA7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHSY3Q70JA7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms