Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SRCAPQ6ZRS2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SRCAPQ6ZRS2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SRCAPQ6ZRS2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SRCAPQ6ZRS2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SRCAPQ6ZRS2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SRCAPQ6ZRS2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SRCAPQ6ZRS2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SRCAPQ6ZRS2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SRCAPQ6ZRS2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SRCAPQ6ZRS2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SRCAPQ6ZRS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SRCAPQ6ZRS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SRCAPQ6ZRS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SRCAPQ6ZRS2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SRCAPQ6ZRS2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SRCAPQ6ZRS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SRCAPQ6ZRS2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SRCAPQ6ZRS2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SRCAPQ6ZRS2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SRCAPQ6ZRS2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SRCAPQ6ZRS2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SRCAPQ6ZRS2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SRCAPQ6ZRS2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SRCAPQ6ZRS2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SRCAPQ6ZRS2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SRCAPQ6ZRS2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SRCAPQ6ZRS2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SRCAPQ6ZRS2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SRCAPQ6ZRS2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SRCAPQ6ZRS2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SRCAPQ6ZRS2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SRCAPQ6ZRS2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SRCAPQ6ZRS2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SRCAPQ6ZRS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SRCAPQ6ZRS2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SRCAPQ6ZRS2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SRCAPQ6ZRS2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SRCAPQ6ZRS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SRCAPQ6ZRS2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SRCAPQ6ZRS2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SRCAPQ6ZRS2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SRCAPQ6ZRS2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SRCAPQ6ZRS2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SRCAPQ6ZRS2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SRCAPQ6ZRS2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SRCAPQ6ZRS2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SRCAPQ6ZRS2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SRCAPQ6ZRS2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SRCAPQ6ZRS2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms