Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MEX3BQ6ZN04 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEX3BQ6ZN04 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEX3BQ6ZN04 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MEX3BQ6ZN04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEX3BQ6ZN04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEX3BQ6ZN04 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEX3BQ6ZN04 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEX3BQ6ZN04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEX3BQ6ZN04 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEX3BQ6ZN04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms