Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE24

RBMS3, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS3Q6XE24 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBMS3Q6XE24 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBMS3Q6XE24 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBMS3Q6XE24 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS3Q6XE24 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBMS3Q6XE24 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS3Q6XE24 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBMS3Q6XE24 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBMS3Q6XE24 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBMS3Q6XE24 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBMS3Q6XE24 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBMS3Q6XE24 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS3Q6XE24 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBMS3Q6XE24 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms