Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB3

LYPD2, Ly6/PLAUR domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD2Q6UXB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD2Q6UXB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD2Q6UXB3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD2Q6UXB3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD2Q6UXB3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYPD2Q6UXB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYPD2Q6UXB3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD2Q6UXB3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD2Q6UXB3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD2Q6UXB3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD2Q6UXB3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD2Q6UXB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD2Q6UXB3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms