Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT46

GAGE2A, G antigen 2A, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE2AQ6NT46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAGE2AQ6NT46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAGE2AQ6NT46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GAGE2AQ6NT46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GAGE2AQ6NT46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GAGE2AQ6NT46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE2AQ6NT46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAGE2AQ6NT46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GAGE2AQ6NT46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms