Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT80Q6KB66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT80Q6KB66 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT80Q6KB66 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT80Q6KB66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT80Q6KB66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT80Q6KB66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT80Q6KB66 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT80Q6KB66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT80Q6KB66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT80Q6KB66 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT80Q6KB66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT80Q6KB66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT80Q6KB66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT80Q6KB66 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT80Q6KB66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms