Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LGALS9CQ6DKI2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGALS9CQ6DKI2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGALS9CQ6DKI2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGALS9CQ6DKI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGALS9CQ6DKI2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGALS9CQ6DKI2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms