Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
E4F1Q66K89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
E4F1Q66K89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E4F1Q66K89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E4F1Q66K89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E4F1Q66K89 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E4F1Q66K89 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
E4F1Q66K89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
E4F1Q66K89 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
E4F1Q66K89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
E4F1Q66K89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E4F1Q66K89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
E4F1Q66K89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
E4F1Q66K89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E4F1Q66K89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E4F1Q66K89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
E4F1Q66K89 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E4F1Q66K89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E4F1Q66K89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms