Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYPL2Q5VXT5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYPL2Q5VXT5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYPL2Q5VXT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYPL2Q5VXT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYPL2Q5VXT5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYPL2Q5VXT5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYPL2Q5VXT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYPL2Q5VXT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYPL2Q5VXT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYPL2Q5VXT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYPL2Q5VXT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYPL2Q5VXT5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms