Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP40Q5TG30 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP40Q5TG30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP40Q5TG30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP40Q5TG30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP40Q5TG30 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP40Q5TG30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP40Q5TG30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP40Q5TG30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGAP40Q5TG30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP40Q5TG30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms