Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPPA-AS1Q5QFB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAPPA-AS1Q5QFB9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms