Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB41Q5JT25 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB41Q5JT25 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB41Q5JT25 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB41Q5JT25 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB41Q5JT25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB41Q5JT25 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB41Q5JT25 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB41Q5JT25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB41Q5JT25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB41Q5JT25 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB41Q5JT25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB41Q5JT25 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB41Q5JT25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms