Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPM1JQ5JR12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPM1JQ5JR12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPM1JQ5JR12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPM1JQ5JR12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPM1JQ5JR12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPM1JQ5JR12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPM1JQ5JR12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPM1JQ5JR12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPM1JQ5JR12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPM1JQ5JR12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPM1JQ5JR12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPM1JQ5JR12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPM1JQ5JR12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPM1JQ5JR12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPM1JQ5JR12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPM1JQ5JR12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1JQ5JR12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1JQ5JR12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1JQ5JR12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPM1JQ5JR12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPM1JQ5JR12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms