Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCA11PQ4W5N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCA11PQ4W5N1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCA11PQ4W5N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCA11PQ4W5N1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCA11PQ4W5N1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCA11PQ4W5N1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCA11PQ4W5N1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCA11PQ4W5N1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCA11PQ4W5N1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms