Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MINDY4Q4G0A6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MINDY4Q4G0A6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MINDY4Q4G0A6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MINDY4Q4G0A6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MINDY4Q4G0A6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MINDY4Q4G0A6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4Q4G0A6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4Q4G0A6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MINDY4Q4G0A6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms