Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP6Q3SY56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP6Q3SY56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP6Q3SY56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP6Q3SY56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP6Q3SY56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP6Q3SY56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP6Q3SY56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP6Q3SY56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP6Q3SY56 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190 ms