Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00303Q3SY05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00303Q3SY05 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00303Q3SY05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00303Q3SY05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00303Q3SY05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00303Q3SY05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00303Q3SY05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00303Q3SY05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00303Q3SY05 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00303Q3SY05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00303Q3SY05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00303Q3SY05 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00303Q3SY05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00303Q3SY05 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00303Q3SY05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00303Q3SY05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms