Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP21-3Q3LHN1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP21-3Q3LHN1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms