Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRAMD1BQ3KR37 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1BQ3KR37 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRAMD1BQ3KR37 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRAMD1BQ3KR37 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRAMD1BQ3KR37 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRAMD1BQ3KR37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRAMD1BQ3KR37 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRAMD1BQ3KR37 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1BQ3KR37 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms