Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWI5Q1ZZU3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWI5Q1ZZU3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SWI5Q1ZZU3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWI5Q1ZZU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SWI5Q1ZZU3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SWI5Q1ZZU3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SWI5Q1ZZU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SWI5Q1ZZU3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms