Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RTL8BQ17RB0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL8BQ17RB0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTL8BQ17RB0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL8BQ17RB0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTL8BQ17RB0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTL8BQ17RB0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL8BQ17RB0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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